Wenn ich ein PSD aus Lightroom an Photoshop schicke, bekomme ich diesen Dialog:
https://dl.dropbox.com/u/993754/PSC/LR-PS.jpg
Erste Option erzeugt ein Kompositbild (Ebenen werden auf den Hintergrund reduziert)
-Das ist wohl das, was bei Dir passiert
Sinnvoll sind dementsprechend Option 2 oder 3...
Bekommst Du den Dialog nicht?
In den Voreinstellungen kann ich keine Möglichkeit erkennen, welche die Dialogbox de/aktiviert (und bei deaktivieren Exportoption 1 als Standard anwendet)...
https://dl.dropbox.com/u/993754/PSC/LR-PS_2.jpg