Hallo!
Ein Smart-Object ist "nur" eine Verknüpfung zur Originaldatei.
Also entweder
1. löschst du Platzieren den Himmel in deiner Originaldatei und speicherst sie als .psd oder einem sonstigen Format, welches Transparenzen unterstützt. Dann kannst du sie Platzieren.
oder
2. du wandelst das Smart-Object um:
Ebenenminiatur markieren > Menü Ebene > Smart-Objekte > Rastern
Nun ist es eine "normale" Ebene auf der du beliebig löschen, maskieren, verschienben, usw. kannst.
oder
3. du markierst auf dem Smart-Object wie gehabt mit dem Zauberpinsel und erstellst aus der Auswahl eine

Ebenenmaske (unten in der Ebenenpalette). Dann wird der entsprechende Bereich maskiert, also ausgeblendet.